车前科与茄科正在大约六千二百万年前从其比来的祖宗处隔离并正在

  金鱼草(Antirrhinum majus L.)也称龙头花(snapdragon),车前科众年生草本植物,因花似金鱼或龙头而得名,是常睹的盆栽、切花及院子抚玩的园艺花草,正在古罗马时间就已完结了驯化。正在过去的三十年中,金鱼草不停动作分子和发育遗传学的形式作物,许众合头基因是正在金鱼草中被初度涌现,包含MADS家族成员DEF、TCP家族成员CYC、节制花瓣外皮细胞样式的MYB基因MIXTA、花色基因ROSEA、VENOSA以及节制自交不亲和的SLFs(S-Loucs F-box)等。金鱼草中内正在活动的转座子煽动了基因的阔别和领悟。可是,迄今为止,这些筹议都是正在短缺基因组序列前提下举行的,无法筹议这些基因、转座子和性状的举座进化和遗宣传局。

  今天,中邦科学院遗传与发育生物学筹议所薛勇彪筹议组结合梁承志筹议组、John Innes中央Enrico Coen筹议组和华大基因等筹议团队,诈骗第二代Illumina基因组测序平台和第三代PacBio单分子测序技能,贯串遗传图谱辅助拼装计谋,完结了对栽培金鱼草(Antirrhinum majus cv. JI7)的全基因组序列测定。

  该筹议取得了金鱼草(2n=2x=16)8条染色体的分子序列510Mb,笼罩度为97.12%,解说了37714个卵白编码基因,通知了一个近乎无缺的金鱼草基因组。通过对序列的斗劲领悟显示,车前科与茄科正在大约六千二百万年前从其比来的先人处分散并正在大约四千六百万到四千九百万年前产生了全基因组复制事故,该全基因组复制对金鱼草中与花过错称性干系的TCP基因家族进化具有紧张功勋。其余,该筹议涌现金鱼草的假S位点(ψS-locus)正在大约2Mb的序列上含有102个基因,个中包括37个SLF基因但缺失S-RNase,提示该花柱因子的损失是栽培金鱼草获取自交亲和性状的合键源由,并涌现栽培金鱼草S-位点与野生金鱼草S-位点之间具有高度的共线性。综上,金鱼草基因组的破译将极大加快这个形式生物的基因组学和进化筹议。

  该筹议结果于1月29日正在线楬橥正在Nature Plants杂志(DOI:10.1038/s4-9)。薛勇彪筹议组李苗苗、张冬芬、张辉,梁承志筹议组高强、马斌,中科院北京基因组筹议所骆迎峰和华大基因陈春海为论文的联合第一作家,薛勇彪、梁承志、Enrico Coen和华大基因尹烨为论文的联合通信作家。该筹议取得中科院策略先导项目、邦度科技部及邦度自然科学基金委的经费援助。

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